做工程需要收取的费用主要包括以下几类：

直接费

人工费：包括施工人员的基本工资、工资性补贴、生产工人辅助工资、职工福利费、生产工人劳动保护费等。

材料费：包括构成工程实体的原材料、辅助材料、构配件、零件、半成品的费用以及材料的检验试验费。

施工机械使用费：包括施工机械作业所发生的机械使用费以及机械安拆费和场外运费。

间接费

规费：包括工程排污费、社会保障费（养老保险费、失业保险费、医疗保险费等）、住房公积金、危险作业意外伤害保险费等。

企业管理费：包括管理人员工资、办公费、差旅交通费、固定资产折旧及修理费、工具用具使用费等。

施工措施费

环境保护费：包括施工现场为达到环保部门要求所需要的各项费用。

文明施工费：包括施工现场文明施工所需要的各项费用，如道路硬化、场地清洁、办公区和生活区的布置等。

安全施工费：包括安全防护用具、设备的购置与更新，施工现场的安全警示标志设置，以及安全培训等费用。

临时设施费：包括施工企业为进行建筑施工所必须搭设的生活和生产用的临时建筑物、构筑物和其他临时设施费用。

夜间施工费：若因工程需要必须在夜间连续施工而发生的费用。

二次搬运费：因施工场地条件限制等原因，材料、构配件、半成品等一次运输不能到达堆放地点，必须进行二次或多次搬运所产生的费用。

其他费用

设计费：包括工程勘察设计费、施工图设计费等。

监理费：由建设单位支付给监理公司的费用，用于监督工程施工质量和进度。

保险费用：包括施工用财产、车辆保险、高空、井下、海上作业等特殊工种保险等。

税金：包括营业税、城乡维护建设税及教育费附加等。

工程排污费：按规定缴纳的排污费用。

其他杂项费用：如土地使用费、技术转让费、技术开发费、业务招待费、排污费、绿化费、广告费、公证费、法律顾问费、审计费、咨询费等。

这些费用通常会在工程合同中明确约定，以确保双方对费用组成和支付方式有清晰的认识。在实际操作过程中，建议仔细审查合同条款，确保所有费用都得到妥善处理。