净化工程的主要组成部分通常包括以下几大部分：

地面系统：

一般采用环氧树脂洁净地面，围护结构系统包括顶、墙、地三部分，即组成三维密闭空间的六个面，还包括门窗、装饰圆弧等。

风管系统：

包括送风、回风、新风、排风管道、末端及控制装置等。空调系统包括冷（热）水机组（包括水泵、冷却塔等）、管路、组合式净化空调箱（包括混流段、初效段、加热段、制冷段、除湿段、加压段、中效段、静压段等）。

自控系统：

包括温度控制、湿度控制、风量风压控制、开启顺序和时间控制等。

电气系统：

照明、动力、弱电三部分，包括净化灯具、插座、电气柜、线路、监控、电话等强弱电系统。

给排水系统：

给水、排水管道、设施及控制装置等。

空气过滤系统：

包括过滤器等其他净化设备，如臭氧、紫外线灯、风淋（包括货淋）、传递窗、超净工作台、互联锁等净化辅助设备。

此外，有些净化工程还可能包括以下附加部分：

装饰装修维护结构系统：涉及地面、天花和隔断等围护结构的系统进行特定的装修，确保空间达到特定的洁净度和卫生标准。

暖通系统：涵盖冷（热）水机组、风冷管道机、空调管路、组合式净化空调箱等设备。

通排风系统：包括进风口、排风口、送风管道、风机、降温及采暖设备、过滤器、控制系统及其他附属设备。

消防系统：包括应急通道、应急灯、喷淋装置、灭火器、消防水带、自动报警设施、防火卷帘等。

工艺管道系统：包括气体管道、物料管道、纯化水管道、注射水管道、蒸汽、纯蒸汽管道、一次水管道、循环水管道、排空排放水管道、凝结水、冷却水管道等。

这些组成部分共同构成了净化工程的完整体系，确保其性能和效果的实现。