制药工程师可以考取多种证书以提升其专业水平和职业竞争力。以下是一些建议考取的证书：

执业药师资格证书

执业药师是通过全国统一考试合格，取得《中华人民共和国执业药师职业资格证书》并经注册，在药品生产、经营、使用和其他需要提供药学服务的单位中执业的药学技术人员。此证书适用于药学类相关专业的毕业生，特别是从事药品生产、经营、使用等工作的药学技术人员。

药剂师证书

药剂师或称药师，是负责提供药物知识及药事服务的专业人员。他们负责监察医生处方中的药物相互作用，为病人建议最适合的药物剂型和剂量。此证书适用于药学、药物制剂等专业的毕业生，通常在医院、药店等医疗机构工作。

药品注册与审批证书

这是制药工程领域非常重要的证书之一，意味着掌握了药品注册与审批的流程和要求。持有此证书的人可以为企业提供专业的注册和审批咨询服务。此证书适用于药学、药物化学等专业的毕业生，特别是从事药品研发、注册等工作的专业人员。

药品生产管理证书

药品生产管理是制药过程中至关重要的一环，对产品的质量和安全性有着直接的影响。此证书涵盖了制药工程中的生产规程、质量管理、设备管理、环境管理等方面的知识。

GMP认证

GMP认证是药品生产质量管理的国际标准，是制药行业必备的认证之一。持有该认证可以证明具有制药生产流程的规范操作和良好的质量管理水平，符合行业标准要求。

工程师证书

工程师证书是考察一个人是否具有一定的工程管理能力的证书。在制药企业中，有一定工程管理能力的工程师会更容易协调各方面资源，规划和实施生产计划。

安全工程师证书

安全工程师证书适用于在制药工程中涉及安全生产管理的工程师，持有该证书可以证明具备安全生产管理的专业知识和能力。

注册化工工程师证书

注册化工工程师是国家职业技能鉴定认证制度的一种，是衡量一个化工工程师及相关工作者职业技能水平的一种标准。持有该证书可以证明具有一定的化学和工程方面的专业知识，并且可在制药生产设备的设计、选型、技术改造等方面提供有力的技术支持。

环评工程师证书

环评工程师证书适用于在制药工程中涉及环境影响评价的工程师，持有该证书可以证明具备环境影响评价的专业知识和能力。

环保工程师证书

环保工程师证书适用于在制药工程中涉及环境保护的工程师，持有该证书可以证明具备环境保护的专业知识和能力。

建议根据个人的职业发展方向和兴趣，选择适合的证书进行考取，以提升自己的专业水平和市场竞争力。