蛋白质工程包括以下内容：

基因重组技术：

通过基因重组技术改变或设计合成具有特定生物功能的蛋白质。

蛋白质分离纯化：

对蛋白质进行分离和纯化，以便于进一步的结构和功能分析。

蛋白质结构和功能分析：

研究蛋白质的结构和功能，包括其化学组成、空间结构与生物功能之间的关系。

蛋白质设计和预测：

根据需求设计合成具有特定氨基酸序列和空间结构的蛋白质，并预测其生物功能。

基因定点突变技术：

通过造成一个或几个碱基的定点突变，修饰蛋白质分子结构，以达到改善其功能的目的。

物理、化学和生物技术的应用：

利用物理、化学和生物技术手段改造蛋白质或设计合成具有特定功能的新蛋白质。

计算机辅助设计：

应用计算机模拟技术辅助蛋白质工程，包括半合理化设计和合理化设计。

蛋白质晶体学和动力学：

研究蛋白质的晶体结构和动力学特性，以获得有关蛋白质理化特性和分子特性的信息。

酶工程：

利用酶、细胞器或细胞的特异催化功能，通过适当的反应器工业化生产人类所需产品或达到某种特殊目的的技术科学。

蛋白质融合：

将编码一种蛋白质的部分基因重组到另一种蛋白质基因上，或将不同蛋白质基因的片段组合在一起，经基因克隆和表达产生新的融合蛋白。

模式分析和分子进化：

对已知的其他蛋白质进行模式分析或采取分子进化等手段，以获得具有新性质或新功能的新蛋白。

AI模型辅助蛋白质设计：

利用人工智能模型辅助进行蛋白质设计，例如2024年EVOLVEpro项目的突破。

这些内容共同构成了蛋白质工程的广泛领域，旨在通过技术手段改造或创造具有特定功能的蛋白质，以满足人类在医疗、工业和其他领域的需求。