工程挂靠公司的税务计算涉及多个方面，以下是一些主要的税费项目及其计算方法：

挂靠费用

挂靠费用通常是按照工程收入的点数收取，一般在5%到13%之间，具体比例可以自行协商。

代征税款

营业税：早期规定按工程结算款计算缴纳，税率为3%。

增值税：

一般纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，适用一般计税方法计税的，以取得的全部价款和价外费用扣除支付的分包款后的余额，按照2%的预征率计算应预缴税款。

一般纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，选择适用简易计税方法计税的，以取得的全部价款和价外费用扣除支付的分包款后的余额，按照3%的征收率计算应预缴税款。

小规模纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，以取得的全部价款和价外费用扣除支付的分包款后的余额，按照3%的征收率计算应预缴税款。

城市维护建设税：根据增值税和消费税的应纳税额计算缴纳，具体税率根据地区不同，一般为7%、5%或1%。

教育费附加：根据增值税和消费税的应纳税额计算缴纳，税率为3%。

地方教育附加：根据增值税和消费税的应纳税额计算缴纳，税率通常为2%。

个人所得税：从事建筑安装业的工程承包人、个体户及其他个人为个人所得税的纳税义务人，其所得应依法缴纳个人所得税。

企业所得税：企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。

管理费

管理费按照行规大约为3%左右收取。

其他费用

根据工程的具体情况，可能还需要缴纳印花税等其他费用。

建议

挂靠建筑公司时，双方应明确各项税费的具体金额和支付方式，确保合法合规。

挂靠方应确保被挂靠方具备相应的资质和证书，避免因资质问题导致的税务风险。

税务计算应综合考虑工程合同金额、工程进度、材料成本等因素，并密切关注国家相关税收政策的调整。

以上信息仅供参考，具体税务计算应根据实际情况和当地税务部门的规定进行。如有疑问，建议咨询专业税务顾问或当地税务部门。