工程排污费的缴纳方式如下：
缴纳主体
建筑施工方：一般由建筑施工方负责缴纳，即乙方。
甲方：虽然甲方可能涉及到环境影响评价（环评），但行政事业性收费一般由乙方缴纳，除非双方有合同约定。
缴纳标准
噪声超标排污费：按照建筑施工时产生的超标噪声分贝值所对应的收费标准（元/月）乘以施工时间（月）。
其他排污费：包括污水排污费、废气排污费、固体废物及危险废物排污费等，具体标准依据当地环保部门的规定。
缴纳时间
施工期间：排污费一般按月度缴纳，具体缴纳时间以当地环保部门的规定为准。
竣工结算：工程排污费在竣工结算时包含在结算工程造价中，最终由甲方支付该笔费用。
缴纳方式
直接缴纳：建筑施工方需将排污费直接缴纳给当地环保部门。
间接缴纳：建设单位在竣工结算时将排污费支付给施工单位，再由施工单位缴纳给环保部门。
注意事项
规费：工程排污费属于规费，应计入工程造价。
取消：根据最新规定，工程排污费现已取消，具体执行情况需咨询当地环保部门。
建议：
建筑施工企业应提前了解当地环保部门的具体规定，确保按时足额缴纳排污费。
甲乙双方应在合同中明确排污费的缴纳责任，避免后期纠纷。
由于政策可能会有变动，建议定期关注环保部门的通知，确保合规操作。
