工程居间费的纳税方式主要取决于居间费是由个人还是企业收取，以及具体适用的税收优惠政策。以下是详细的纳税方法：

个人收取居间费

个人所得税：个人收取的居间费需要按照劳务报酬所得缴纳个人所得税，税率在20%~40%之间。如果居间费为400万元，按照20%的税率计算，个人需要缴纳80万元个税，实际税负可能因扣除项和税收优惠而有所不同。

税收优惠政策：

双免个体户：年度业务金额在120万元内，季度在30万元内（开普票）可以申请免个税和免增值税，综合税负几乎为零。

大额个体户核定征收：年度业务金额在120万元以上至450万元以内，可以申请核定征收，综合税率仅为1.66%。

企业收取居间费

增值税：工程居间费属于增值税应税行为，一般纳税人适用13%的税率，小规模纳税人适用3%或5%的税率（具体税率根据最新政策调整）。

企业所得税：企业收取的居间费需要缴纳企业所得税，根据《中华人民共和国企业所得税法》的规定进行缴纳。

税收优惠政策：

定额征收：企业可以在税收园区注册一般纳税人有限公司，通过定额征收的方式解决大额居间费问题，综合税率约为9%。

核定征收：营业额在120万元以上的个体户，可以选择核定征收，核定税率在0.5%—1%之间。

建议

个人：如果预计年收入较高，可以考虑成立个体户并享受税收园区的优惠政策，如双免政策或大额个体户核定征收，以降低税负。

企业：企业可以根据自身情况选择一般纳税人或小规模纳税人进行纳税，并合理利用税收园区的优惠政策来降低税负。

请注意，具体的税收政策和税率可能随时间变化，建议在实际操作前咨询当地税务局或专业税务顾问以获取最新信息。