工程款支付的签字流程如下：

预付款支付流程

施工单位提交预付款《工程款支付申请表》给预算专员，施工单位项目经理需签字确认。

预算办根据合同约定的预付比例审核预付款，并签署预付款《工程款支付申请表》，然后交给财务部。

财务部再次复核后，将审核通过的《工程款支付申请表》交给总经理和董事长审批，最终交给出纳安排付款。

进度款支付流程

施工单位先向工程部提交进度款《工程款支付申请表》，要求附上已完工程的预算书，一式三份（工程部、预算办、财务部各一份），施工单位项目经理需签字。

工程部审核当月完成的部位及项目和相关工程量，审核完毕后由工程部经理签字交到预算专员。

预算专员审核已完成工程量及工程预算价，确定当月完成工程造价，根据合同约定审批工程款，然后预算专员签字确认。

预算专员将进度款《工程款支付申请表》上交财务部审核，财务部审核无误后，将申请表交由总经理和董事长审批。

施工单位根据审核通过的进度款《工程款支付申请表》中的金额开具当地建安发票，发票内容需与申请表中的工程项目一致，然后将申请表及发票上交财务部，财务部复核金额和发票内容无误后，交到出纳处办理转付。

结算款支付流程

工程完工后，施工单位向预算专员提交电子版的结算书，并提供相关的设计变更、工程联系单、工程签证单等。

预算专员根据提供的结算书和相关文件审核工程造价，并签署结算款《工程款支付申请表》，然后交给财务部。

财务部审核无误后，将结算款《工程款支付申请表》交由总经理和董事长审批，最终交给出纳办理付款。

建议在实际操作过程中，各方应严格按照上述流程进行签字和审核，确保工程款支付的准确性和合规性。