工程项目部纳税主要涉及以下几个方面：
增值税
根据《纳税人跨县（市、区）提供建筑服务增值税征收管理暂行办法》，一般纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，可以选择一般计税方法或简易计税方法。
一般计税方法下，应预缴税款 = （全部价款和价外费用 - 支付的分包款） ÷ （1 + 9%） × 2%。
简易计税方法下，应预缴税款 = （全部价款和价外费用 - 支付的分包款） ÷ （1 + 3%） × 3%。
对于小规模纳税人，若月销售额未超过规定限额，可以免征预缴税款。
城市维护建设税
计税依据为预缴的增值税税额，税率根据施工项目所在地确定，市区为7%，县城、建制镇为5%，其他地区为1%。
教育费附加和地方教育附加
计税依据为预缴的增值税税额，费率分别为3%和2%。
个人所得税
通常按工程结算款计算缴纳个人所得税，税率为1%。
企业所得税
建筑企业总机构直接管理的跨地区设立的项目部，需要按照项目实际经营收入的0.2%按月或按季预缴企业所得税。
二级或二级以下分支机构直接管理的项目部，其所得税应汇总到二级分支机构统一核算后预缴。
其他税费
包括印花税、房产税、土地使用税等，具体税率和计算方法依据相关税法规定执行。
请注意，税法规定可能会有更新，具体纳税义务和计算方法应以最新的税法规定和地方税务机关的具体要求为准。建议咨询当地税务机关或专业税务顾问获取最新信息
