工程外包施工费的支付方式可以有以下几种：

按进度付款

工程承包人可以根据工程的进度来分期支付施工费用。即每完成一定的工作任务后，支付一定比例的工程款。这种方式能够确保工程的顺利进行，并且可以根据实际情况灵活调整付款比例。

预付款

在签订工程承包合同时，承包人可以先预付一部分款项，待工程完工并通过验收后，再一次性支付剩余的工程款。这种方式有助于减轻承包人的资金压力，但需要注意预付款的金额和退款条件。

固定金额式承包费

双方可以协商确定一个固定的承包费用，无论工程的具体进度如何，承包人都会按照这个金额进行收费。这种方式简单明了，但可能无法准确反映工程的实际成本。

比例式承包费

承包费用可以根据工程的具体进度或完成的工作量按照一定比例进行支付。这种方式能够更准确地反映工程的实际成本，但需要双方协商确定合理的比例。

保底金额加比例式承包费

承包费用包括一个保底金额，无论工程进度如何，承包人都会获得这个保底金额。此外，还可以根据工程的进度或完成的工作量按照一定比例支付额外费用。这种方式能够保障承包人的基本收益，同时也能激励其提高工作效率。

税务处理

在支付工程外包施工费时，需要注意以下几点税务处理：

增值税

承包人需要自行到税务局开具工程劳务费发票，并缴纳增值税，税率一般为3%。

城建税和教育费附加

根据实际缴纳的增值税、营业税（如适用）和消费税计算，分别缴纳城建税和教育费附加。城建税的税率根据纳税人所在地不同，分别为市区7%、县城和镇5%、乡村1%。

个人所得税

如果分包给个人或个体户，其支付的分包款项不能扣除，需要全额计入营业额缴纳个人所得税。

建议

明确合同条款：在签订工程承包合同时，应明确约定付款方式、金额、税务处理等关键条款，以避免后期纠纷。

合理规划税务：承包人应合理规划税务，确保依法纳税，避免因税务问题影响工程进度和收益。

选择合适的付款方式：根据工程的具体情况和双方的需求，选择合适的付款方式，以确保工程的顺利进行和双方的权益。