借用资质做工程结账的方法如下：

工程款支付方式

直接打入借用资质公司的对公账户：根据《建筑法》第六十六条，借用他人资质承揽工程的，工程款应直接打到借用的资质公司的对公账户上。

通过约定转账：借用方（如甲公司）和出借方（如乙公司）可以约定将工程款从乙公司账户转账到甲公司账户。

税务处理

缴纳税款：当工程款到账后，借用资质的公司需要先缴纳相关税款，如营业税、城建税、教育附加等，然后将剩余款项转入借用方的账户。

发票管理：挂靠方需要提供相应的发票，包括材料、设备、直接费、间接费、工资表等，以便进行税务申报和账务处理。

会计处理

收入确认：收到甲方拨款时，记入“银行存款”科目，同时增加“应收账款--甲方”科目。

成本结转：在工程结算时，确认收入并结转成本，具体分录包括：

借：应收账款--甲方

贷：工程结算

借：工程结算

贷：工程施工--毛利

贷：工程施工--成本项目

税金计提：根据发票内容计提税金，如营业税、城建税等，具体分录包括：

借：主营业务税金及附加

贷：应交税金--营业税

贷：应交税金--城建税

贷：其他应交款--教育附加

贷：其他应交款--地方教育附加

法律责任

非法所得收缴：人民法院可以收缴当事人已经取得的非法所得。

连带责任：挂靠者与被挂靠者对工程质量承担连带责任，不影响其他部分效力的仍然有效。

建议

合规性：借用资质做工程存在法律风险，建议遵守相关法律法规，避免非法所得。

合同明确：在签订合同时，明确工程款支付方式、税务处理、责任分配等关键条款，以减少纠纷。

专业咨询：在实际操作中，建议咨询专业会计师或律师，确保账务处理的合规性和准确性。