工程预算的结算方式有以下几种：

预算结算方式

以审定确认的施工图预算作为竣工结算的依据。

施工过程中发生的未包括的项目和费用，需建设单位驻现场工程师签证，并在工程结算时进行调整。

承包总价结算方式

工程承包合同为总价承包合同。

竣工后，暂扣合同价的2%~5%作为维修金，其余工程价款一次结清。

施工过程中发生的材料代用、主要材料价差、工程量变化等均在结算时一并处理。

平方米造价包干方式

承发包双方根据工程资料，协商签订每平方米造价指标的合同。

结算时按实际完成的建筑面积汇总结算价款。

此方法手续简便，但适用范围有限。

工程量清单结算方式

采用清单招标时，中标人填报的清单分项工程单价是承包合同的组成部分。

结算时按实际完成的工程量，以合同中的工程单价为依据计算结算价款。

按完成工程目标进行结算

根据工程合同中约定的各项工程目标，完成一个目标后进行结算。

按单项工程或单位工程的形象进度划分不同阶段进行结算

将工程划分为不同阶段，每个阶段完成后进行结算。

按当月完成的有效工程量进行结算

每个月根据实际完成的工程量进行结算。

完成工程后一次性付清款项

工程全部完成后，一次性支付所有工程款项。

按月结算

实行旬末或月中预支，月终结算，竣工后清算。

跨年度竣工的工程，在年终进行工程盘点，办理年度结算。

竣工后一次结算

建设项目或单项工程全部建筑安装工程建设期在12个月以内，或者工程承包价值在100万元以下的，可以实行工程价款每月月中预支，竣工后一次结算。

分段结算

当年开工，当年不能竣工的单项工程或单位工程按照工程形象进度，划分不同阶段进行结算。

目标结算方式

在工程合同中，将承包工程的内容分解成不同的控制界面，以业主验收控制界面作为支付工程款的前提条件。

这些结算方式各有优缺点，适用于不同的工程类型和实际情况。选择合适的结算方式有助于确保工程顺利进行并控制成本。建议在实际操作中，根据工程的具体情况、合同条款及双方协商，选择最合适的结算方式。