工程合同的签字方式如下：
当事人协商一致
双方当事人就合同内容协商一致后，采用书面形式订立合同。
在合同最后，当事人应当签字、盖章或者按手印。
合同书形式
当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。
合同签订流程
由合同预算部负责合同的起草、谈判和组织会签。
各相关部门按照规定进行合同的审批。
审批全部完成后，由合同预算部将审批意见与最终签字、盖章的合同文本对照，无误的办理签字盖章手续。
法律依据
根据《中华人民共和国民法典》第七百八十九条，建设工程合同应当采用书面形式。
第七百九十五条，施工合同的内容一般包括工程范围、建设工期、中间交工工程的开工和竣工时间、工程质量、工程造价、技术资料交付时间、材料和设备供应责任、拨款和结算、竣工验收、质量保修范围和质量保证期、相互协作等条款。
其他注意事项
合同签订前应仔细审查合同内容，确保内容合法、条款齐全、文字清楚、表述规范、权利义务和违约责任明确、期限和数字准确。
在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
通过以上步骤和注意事项，可以确保工程合同的签字过程合法、有效，保障双方当事人的权益。
