物流工程的结构主要包括两大类：
总体的网络工程系统
该系统关注物流活动的整体规划和布局，包括物流节点（如仓库、配送中心）的选址、物流路径的选择、运输方式的综合运用等。
详细的技术工程系统
包装工程：运用各种材料、装备、设施，形成不同形态的包装，以支撑物流活动。包装工程进一步细分为一般物流包装工程和集装工程两大领域。集装工程包括托盘工程、集装箱工程、集装袋工程及其他集装工程。
储存工程：利用仓库和其他存储设备、设施，使储存环节按物流总体要求进行运作。储存工程系统是物流领域向现代化发展的重点领域，包括高层立体货架系统、自动化存取系统、无人搬运系统、计算机库存管理系统等。
输送工程：包括传统的交通运输领域，并运用系统的物流技术对传统运输方式进行提升。现代物流系统的输送工程特别重视不同传统运输方式的组合，出现了“门到门”、“库到库”甚至“线到线”的高水平输送方式。
此外，物流系统的三大结构包括：
仓储管理系统：
通过以计算机技术为基础的信息系统，实现对商品的加工、贮存和管理的系统。
运输管理系统：
负责物流运输活动的规划、组织和协调，确保货物按时、安全、高效地运达目的地。
配送管理系统：
涉及将货物从仓库或配送中心按照客户要求，通过适当的运输方式和路径，准确、及时地送达客户手中的过程。
综上所述，物流工程的结构涵盖了从总体网络规划到具体技术工程系统的多个层面，旨在优化物流系统的设计、运营和管理。
