工程所得税的处理主要包括以下几个方面：
企业所得税预缴
建筑企业总机构直接管理的跨地区设立的项目部，应按项目实际经营收入的0.2%按月或按季由总机构向项目所在地预分企业所得税，并由项目部向所在地主管税务机关预缴。
个人所得税代扣代缴
总承包企业、分承包企业派驻跨省异地工程项目的管理人员、技术人员和其他工作人员在异地工作期间的工资、薪金所得个人所得税，由总承包企业、分承包企业依法代扣代缴并向工程作业所在地税务机关申报缴纳。
个人所得税计算
工程个人所得税的计算方式是以个人每一纳税年度的经营收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，为个人应纳税的所得额。
所得税征收方式
建筑行业企业所得税的征收方式分为查账征收和核定征收。查账征收是根据企业利润情况按季预缴，年末汇缴；核定征收则是根据开发票额度计算应纳税所得额。
偷税漏税的处罚
建筑业偷税漏税企业所得税会受到法律严厉处罚，可能包括罚款和刑事责任。
发票处理
对于代开发票所支付的增值税金及附加等，需要做相应的会计分录。
所得税的计提与缴纳
季度所得税预缴时，建筑企业扣除已由项目部预缴的企业所得税后，按照其余额在机构所在地缴纳。
优惠政策
根据业务情况，可以选择申请享受到园区中的核定征收政策、自然人代开政策或个体工商户的优惠政策。
请根据具体情况选择合适的所得税处理方法，并确保遵守相关税法规定。
