针对工程扰民的问题，可以采取以下措施来处理：

协商

首先，可以直接找工地负责人或公司负责进行协商，明确提出要求停止违法施工行为，确保施工活动在合法合规的时间内进行，并采取措施降低噪音等污染。

投诉

如果协商无果，可以联系当地的相关行政部门，确认工地是否具有夜间施工资格，并对扰民行为进行举报投诉。要求行政部门进行整治查处，以保障周边居民的合法权益。

可以拨打以下电话进行投诉：

环保部门：12369

城管部门：12319（注意：原文中未提及12319，但根据常识，城市管理部门通常使用此电话）

住房建设部门：根据具体情况，可以向当地的住房建设部门或物业公司投诉。

法律途径

如果工程扰民行为依旧存在，特别是噪音扰民，受害人可以收集相关证据资料，如录音、视频等，向法院提起诉讼，要求停止侵害并赔偿相关的损失，包括精神损失和物质损害等。

提起诉讼需要满足以下条件：

有明确的被告，即扰民行为的实施者或责任单位。

原告需要提出具体的诉讼请求和事实、理由，明确要求被告停止侵害行为并赔偿损失等。

案件必须属于人民法院受理民事诉讼的范围，并且受诉人民法院具有管辖权。

其他措施

如果施工单位已经办理了夜间施工许可证明，但仍旧扰民，可以向相关部门反映情况，要求施工单位严格遵守夜间施工的相关规定。

施工单位也应当采取先进的设备和技术，尽量减少噪音、扬尘等对居民的影响，并与业主协商，相互谅解。

通过以上措施，可以有效地解决工程扰民问题，维护周边居民的合法权益。