工程预算审计的审核过程可以遵循以下步骤：

审查《工程承包合同》及相关合同

确认是否签订了项目承包合同，合同双方是否具有法人资格和相应的履约能力，内容是否合规完整。

审查合同中的权、责、利划分是否明确，如有分包工程，还需审查《工程分包合同》。

审查工程施工准备工作情况

核实施工组织设计是否先进，现场施工队伍和机械设备的配置能否满足需要。

检查指挥部的设置、定员、人员素质是否符合管理要求，确保精干高效、结构合理。

工程预算编制审查

确认是否编制了工程项目成本预算、费用预算、资金预算，编制依据是否充分，内容是否完整。

审查预算定额是否合理，是否符合行业规范。

内控制度建立的审查

检查是否建立了工程预算管理、合同管理、工资管理、成本管理、设备材料管理、安全质量管理、财务管理、分包工程管理等一系列管理制度。

确认各项制度是否完善、严密。

掌握审核成本编制的前提条件

根据招标文件规定的相关施工范围、招标方式和工程进度进行核查，确认核查内容与招标文件所包含的内容相符。

核查图纸是否与业主的图纸一致，如有疑问，及时与业主进行沟通，确保核查项目与在建项目一致。

核对工程量

全面仔细地检查图纸是否存在遗漏部分，必要时可借助第三方造价咨询公司或设计公司审查工程中标，确保一切无误。

如发现审核过程中有差异，应及时确认差异，并查明差异原因。

综合价格审查

对综合价格进行认真仔细的审查，确保综合价格的合理性。

使用不同的审计方法

看图法：通过查看施工图纸来核实工程量与工程价款，审定工程造价。

观察法：审计人员亲临建筑现场，对审计事项进行实地观察，调查了解建设项目的实际情况，发现疑点，验证事实，核实实际工程量，审定工程造价。

审核竣工结算编制依据

确认编制依据是否符合国家有关规定，资料是否齐全，手续是否完备，对遗留问题处理是否合规。

审核工程量

重点审核投资比例较大的分项工程，如基础工程、混凝土钢筋混凝土工程、钢结构等。

审核容易混淆或出漏洞的项目，以及容易重复列项和重复计算的项目。

对于无图纸的项目要深入现场核实，必要时可采用现场丈量实测的方法。

审核材料用量及价差

核实主要材料的消耗数量是否准确，列入直接费的材料是否符合预算价格。

审核预算报告

对工程预算报告进行初步审核，包括预算金额是否合理、编制是否符合相关规范等。

评估项目资金需求的合理性和可行性，确定工程预算是否满足项目的实际需求。

审核工程预算报告中涉及的技术方案，包括技术可行性、技术合理性等。

审核工程预算报告中的成本核算、费用合理性等。

评审工程预算报告中的资金来源、资金落实情况等，确定资金的可行性和安全性。

根据审批决策结果，进行必要的预算调整和修改。

对修改后的工程预算进行最终审核，确保预算的准确性和合理性。

将最终审核通过的工程预算报告报备备案，以备后续合同签订和工程实施使用。

通过以上步骤，可以全面、细致地对工程预算进行审计，确保其合理性、合规性和准确性。