工程师因工受伤导致大脑功能受损的赔偿问题，主要依据《中华人民共和国社会保险法》和《工伤保险条例》等相关法律法规进行处理。以下是具体的赔偿项目及标准：

医疗费用和康复费用

治疗工伤所需费用应符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准。这些费用从工伤保险基金中支付。

住院伙食补助费

工伤职工住院治疗工伤的伙食补助费从工伤保险基金支付。具体标准为本单位因公出差伙食补助标准的70%。

交通费和食宿费

如果工伤职工需要到统筹地区以外就医，其交通食宿费用也从工伤保险基金中支付。需要医疗机构出具诊断证明，经办机构同意。

停工留薪期工资

在停工留薪期内，工伤职工的原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。

一次性伤残补助金

根据劳动能力鉴定结果，如果构成伤残等级，会有一次性伤残补助金。具体标准根据伤残等级确定。

伤残津贴

伤残等级较高的，离职时还可获得一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金。具体标准由各省、自治区、直辖市人民政府规定。

生活护理费

如果工伤职工生活不能自理，经劳动能力鉴定委员会确认后，生活护理费由工伤保险基金或用人单位支付。

辅助器具费

工伤职工因日常生活或就业需要配置假肢、矫形器等辅助器具的，费用按照国家规定的标准由工伤保险基金支付。

精神损害赔偿金

在某些情况下，工伤职工还可以要求精神损害赔偿金。具体金额需根据案件具体情况而定。

建议

工伤职工应及时进行工伤认定和劳动能力鉴定，以确保自身权益得到保障。

保留所有与工伤相关的医疗文书和费用记录，以便在协商或诉讼过程中使用。

如果与用人单位或保险公司存在分歧，可以依法向劳动争议仲裁委员会提出申诉或直接向法院提起诉讼。

希望以上信息能对您有所帮助。