挖土方工程的开票方式如下：
申请代开建筑业统一发票
挖土方工程的税目属于“建筑安装业-其他工程作业”，营业税税率为3%。
一般纳税人提供建筑服务，按照一般计税法下增值税税率为9%。
小规模纳税人提供建筑服务适用征税率为3%，应交增值税=（全部价款-分包款）/（1+3%）×3%。
应到主管地税申请代开“建筑业统一发票”。
发票的管理和使用
土方票由项目部财务室从公司财务部领取，建立健全签字、登记台账，完善手续。
发票人员需到项目部财务室领取土方票，签字登记，建立台账，并在下一次领票前上交前一次的土方票存根。
土方票由项目部统一加盖指定的印章。
发票的发放和核实
土方票应指定专人发放，发票人在倒土区或施工面现场指挥发票，如发现拉土车没有装满或倒土不净，发票人可拒绝发票，情节严重的应向项目部汇报给予罚款。
土方票应当天发放当天核实，如有遗失应及时上报项目部处理，不得隐瞒不报或虚报。
自然人代开
通过自然人代开，需要提供业务合同、资金和发票三流一致的相关证明，一般1-2天即可完成开票。完税证明和发票一起出具，真实可查验，个税属于经营所得，不涉及年度汇算清缴。
建议：
挖土方工程的开票应严格按照相关税法规定执行，确保合法合规。
建立健全的发票管理制度，确保发票的准确发放和核实。
对于一般纳税人和小规模纳税人，应分别按照相应的税率进行增值税的申报和缴纳。
