在建工程审计的目标主要是确定在建工程是否存在、所有权的归属、本年度增减变化的记录完整、减值准备计提方法，以及会计报表披露是否恰当等。以下是一些具体的审计程序：

获取或编制在建工程明细表

核对明细账与总账的余额是否相符。

检查本期在建工程增加、减少数，了解相关预算、结算、决算资料，核算政策、工程合同、协议等法律文件。

检查在建工程交付使用、竣工、完工情况及工程进度等。

检查在建工程期末余额的构成内容

实地观察工程现场，确定在建工程是否存在。

了解工程项目的实际完工进度，查看未安装设备的实际存在情况。

查询工程项目投保、抵押情况

确认在建工程是否已投保，抵押情况是否合规。

检查在建工程在资产负债表上的披露是否恰当

核实资产负债表上在建工程的披露是否符合会计准则要求。

审计程序

获取或编制在建工程明细表，核对明细账与总账的余额是否相符。

检查在建工程项目、规模是否经授权批准。

抽查年度在建工程增加数的原始凭证是否齐全，会计处理是否正确。

检查已完工程项目以及其他转出数的原始凭证是否齐全，会计处理是否正确。

检查在建工程账户年末余额构成内容，并到工程现场实地观察、了解工程项目的实际完工进度，查看未安装设备的实际存在。

检查是否存在已交付使用，但未办理竣工交付使用手续，未及时进行会计处理的项目。

检查在建工程合约，以确定约定资本性支出。

验明在建工程是否已在资产负债表上恰当披露。

其他审计方法

看图法：通过查看施工图纸，核实工程量与工程价款，审定工程造价。

观察法：亲临建筑现场，实地观察，了解建设项目的实际情况。

询问法：通过询问相关管理人员和当事人，证实基建工程量与工程价款的真实性、合理性。

调查法：深入实际进行调查研究，查证基建工程量与工程价款的真实性、合理性。

开挖法：对有疑点的隐蔽工程进行挖开核实工程量与工程价款。

分析法：运用系统方法，对基建工程项目的具体内容进行分离和分类，发现疑点，揭露问题。

测量法：实地测量有关工程量，计量有关器材物质数量，确定核实基建工程决算工程量与造价的真实性、合理性。

核对法：用不同记录或资料进行查对，验证基建工程决算工程量与造价的真实性、合理性。

通过以上审计程序和方法，可以全面、系统地对在建工程进行审计，确保其真实性、完整性和合规性。