工程代理服务费的计算方法主要有以下几种：

差额定率累进计费方式

这种方法是根据中标金额的不同，按照一定的比例累进计算费用。具体标准可以参考相关文件，如《国家计委关于印发的通知》（计价格〔2002〕1980号）。

按建设工程投资的百分比计算方法

按照委托监理工程概（预）算的百分之十计收工程监理费。当工程结算时，可以根据实际工程投资进行调整。这种方法是国家制定监理取费标准的主要形式。

固定价格计算法

建设单位与工程监理企业在协商一致的基础上，形成监理合同的固定价格。这种价格可以是固定总价或固定单价，特点是在实际监理工作量与计划工作量有增减时，一般不调整监理费的总价或单价。

示例计算

以中标金额为6000万元的工程招标代理业务为例，采用差额定率累进计费方式计算费用如下：

1. 100万元以下部分：100万元 × 1.0% = 1万元

2. 100-500万元部分：（500-100）万元 × 0.7% = 2.8万元

3. 500-1000万元部分：（1000-500）万元 × 0.55% = 2.75万元

4. 5000-1000万元部分：（5000-1000）万元 × 0.35% = 14万元

5. 10000万元以上部分：（6000-5000）万元 × 0.2% = 2万元

合计收费：1 + 2.8 + 2.75 + 14 + 2 = 22.55万元。

建议

选择合适的计算方法：根据具体的工程规模、合同条款以及市场情况，选择最合适的计算方法。

注意费用调整：在工程实施过程中，若实际投资与预算有出入，应及时调整监理费用，确保费用计算的准确性和合理性。

咨询专业机构：在实际操作中，建议咨询专业的招标代理或工程监理机构，以确保收费标准的合规性和准确性。