支付工程款的记账方法如下：

确定支付原因

明确支付工程款的具体原因，如建设、修缮、扩建等，以便选择正确的记账凭证。

确定付款方式

根据实际情况选择付款方式，如现金支付、银行转账或信用卡支付等。

填写支付凭证

填写收款单位、支付人、支付项目、支付金额及其他相关信息，确保凭证完整准确。

出纳登记

记录出纳登记，包括支付工程款的摘要、费用用途及收支金额等，以便于后续稽核。

账簿核对

将支付工程款及其详细信息记录到账簿，并与出纳登记进行核对，确保账目一致。

记录报表

将支付工程款的内容记录到财务报表上，供上级审核。

会计分录示例：

自营在建工程：

```

借： 在建工程

贷： 银行存款

```

出包在建工程：

```

借： 在建工程

贷： 银行存款

```

支付工程尾款：

```

借： 应付账款—某项工程—施工单位

贷： 银行存款

```

支付已结算工程尾款：

```

借： 应付账款—某项工程—分包施工单位

贷： 银行存款

```

支付工程款并涉及税金和手续费：

```

借： 工程施工成本/在建工程

借： 税金及附加

借： 手续费用

贷： 银行存款

```

注意事项：

在建工程通常包括固定资产的新建、改建、扩建、技术改造、设备更新和大修理工程等尚未完工的工程支出。

在建工程有“自营”和“出包”两种方式，记账方法有所不同。

支付工程款时，需要考虑进项税额的处理，具体分录取决于是否涉及增值税。

通过以上步骤和示例，可以确保工程款的支付记账过程准确无误，符合相关会计准则和法规要求。