工程增值税的计算方法主要取决于纳税人是选择一般计税方法还是简易计税方法。以下是两种方法的详细计算步骤：

一般计税方法

确定销项税额

销项税额 = 含税工程款 / （1 + 9%） × 9%

计算应纳税额

应纳税额 = 销项税额 - 进项税额 + 进项税转出 - 期初留抵税额 - 异地预缴增值税

简易计税方法

确定销项税额

销项税额 = 含税工程款 / （1 + 3%） × 3%

计算应纳税额

应纳税额 = 销项税额 - 进项税额

纳税人身份

一般纳税人：可以选择一般计税方法或简易计税方法。

小规模纳税人：只能选择简易计税方法，征收率为3%。

附加税计算

工程附加税：已交增值税 × 附加税适用税率（如城市维护建设税7%，教育费附加3%，地方教育附加2%）。

印花税

建设工程施工合同：需要缴纳印花税，按合同承包金额万分之三计算。

示例

假设某承包商为一般纳税人，承接了一项建筑工程，约定价款为100万元，增值税税率为9%。

计算销项税额

销项税额 = 100万元 / （1 + 9%） × 9% = 8.26万元

假设进项税额为5万元

计算应纳税额：应纳税额 = 8.26万元 - 5万元 = 3.26万元

计算附加税

假设附加税适用税率为10%：工程附加税 = 3.26万元 × 10% = 0.326万元

总税额

总税额 = 3.26万元 + 0.326万元 = 3.586万元

建议

纳税人应根据自身情况选择合适的计税方法，以合法合规地减轻税负。

准确计算进项税额和销项税额，确保应纳税额的准确性。

注意及时预缴税款，避免因未按时预缴而产生滞纳金或罚款。