当工程赔钱时，可以采取以下步骤来处理：

查明原因

确定造成亏损的根本原因，如合同条款存在歧义、工程质量瑕疵、施工进度延误或不可抗力因素等。

如果是对方违约，如业主未按时支付工程款，可以根据合同条款依法维权，要求违约方承担相应的赔偿责任。

收集证据

整理所有相关的费用收支证明、合同协议等关键性证据，以便在可能的法律争议中占据优势。

协商解决

尝试与对方进行协商，寻求合理的解决方案。如果协商无果，可以考虑其他途径。

法律途径

如果协商无效，可以通过调解、仲裁或诉讼等法律途径解决争议。

对于工人工资问题，可以向劳动监察大队投诉，或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，不服仲裁裁决的可以向人民法院提起诉讼。

合同条款解释

对于合同条款不明确或存在争议的情况，可以参照相关法律规定和行业惯例进行解释和处理。

止损措施

及时采取措施止损，如停止进一步的施工活动，以避免更大的经济损失。

专业咨询

在处理复杂的法律和经济问题时，建议咨询专业律师，获取更具体的法律建议和支持。

合同履行与变更

如果工程已经进行到一半，应仔细评估是否继续履行合同或寻求其他解决方案，同时注意可能涉及的违约责任。

索赔机会

仔细审查合同条款和工程过程中可能出现的索赔机会，如业主行为、设计变更等，并准备相应的证据和文件。

法律依据

在整个处理过程中，依据《中华人民共和国民法典》、《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规，确保自身权益得到合法保护。

通过上述步骤，可以更系统地处理工程赔钱的问题，并尽可能减少经济损失。