工程款项的税金计算涉及多个税种，具体计算方式如下：

增值税

增值税的计算公式为：应纳增值税 = 当期销项税额 - 当期进项税额。

当期销项税额分两种情况：

材料销售的当期销项税额：当期不含税销售收入 × 13%。

工程施工的当期销项税额：当期不含税销售收入 × 9%。

如果工程在外地（跨地市、跨省），需要办理《跨区域涉税事项报告》并在工程所在地预交税款，企业可以选择在工程所在地全额预交，也可选择差额预交。全额预交是按不含税销售收入的3%在工程所在地预交，差额预交是按不含税销售收入的2%在工程所在地预交，剩余1%回企业所在地计算缴纳。

城市维护建设税

城市维护建设税根据缴纳的增值税额来计算，税率按照工程所在地的城乡类型不同分别确定税率，市区为增值税额的7%，乡镇为增值税额的5%，其他为增值税额的1%。

教育费附加和地方教育费附加

教育费附加的税率为增值税额的3%，地方教育费附加的税率为增值税额的2%。

这两项费用与增值税一并计算缴纳。

印花税

印花税按建筑安装工程承包合同金额的0.3‰计算缴纳。

个人所得税

个人所得税按工程结算款计算缴纳，税率为1%。

综合计算示例

假设某工程的不含税营业收入为100万元，增值税率为9%，则：

增值税 = 100万元 × 9% = 9万元。

城市维护建设税（市区）= 9万元 × 7% = 0.63万元。

教育费附加 = 9万元 × 3% = 0.27万元。

地方教育费附加 = 9万元 × 2% = 0.18万元。

印花税 = 100万元 × 0.3‰ = 0.3万元。

个人所得税 = 100万元 × 1% = 1万元。

总税额= 增值税 + 城市维护建设税 + 教育费附加 + 地方教育费附加 + 印花税 + 个人所得税

= 9万元 + 0.63万元 + 0.27万元 + 0.18万元 + 0.3万元 + 1万元

= 11.38万元。

建议

纳税人应详细掌握相关税收政策，并根据工程所在地和具体业务情况，准确计算各类税种的税额。

对于跨地区的工程项目，需要特别注意异地预交税款的规定，以确保合规操作。