处理部队拖欠工程款的问题，可以采取以下几种方式：
协商
首先，可以尝试与部队进行协商，以解决工程款拖欠的问题。在协商过程中，应明确双方的权利和义务，列出无争议和有争议的项目，并尽量达成一致意见。
调解
如果协商无果，可以寻求第三方调解机构的帮助，通过调解来解决纠纷。调解可以在自愿友好的基础上进行，有助于双方达成和解协议。
仲裁
可以向仲裁机构提出仲裁申请，但需要满足一定的条件，例如有仲裁协议、具体的仲裁请求和事实理由等。仲裁是一种替代诉讼的解决方式，具有程序简便、效率高的特点。
诉讼
如果协商和调解均无法解决问题，可以选择向法院提起诉讼。在提起诉讼前，需要收集相关证据，如工程完工证明、合同、支付记录等，以证明自己的权益。同时，可以选择工程所在地或被告所在地的人民法院进行起诉。
法律途径
如果协商无果，可以依据《中华人民共和国民法典》第八百零七条的规定，催告发包人在合理期限内支付价款。若发包人逾期不支付，可以协议将该工程折价，或请求人民法院将该工程依法拍卖，并优先受偿。
强制执行
如果法院判决或仲裁裁决生效后，发包人仍不履行支付义务，可以申请法院强制执行。法院会依法查询债务人名下的财产，并采取相应的执行措施。
在处理部队拖欠工程款的问题时，建议采取多种方式并行的策略，以最大化地维护自己的合法权益。同时，确保所有行动均符合法律法规的要求，并在必要时寻求专业律师的帮助。
