工程审计是一个系统的过程，它涉及对工程项目从立项到竣工验收各个环节的合法性、合规性、经济性及效益性进行审查和评价。以下是工程审计的主要步骤和方法：

项目立项与规划审计

审查项目立项的合法性和合理性，确保项目符合国家政策、法规及行业标准。

检查项目规划、设计方案是否符合技术标准和行业规范，是否科学合理。

资金与预算审计

核实项目预算的编制是否科学合理，资金是否充分，是否符合项目实际需求。

审查项目资金的使用是否严格按照预算执行，是否存在浪费、挪用或其他不合规行为。

检查合同条款中关于付款、结算等方面的支付是否符合约定。

合同与招投标审计

审查招标程序是否公开、公正，是否遵循相关法规及行业规范。

检查项目合同是否明确权责，合同条款是否公平合理，是否对项目目标和各方责任进行了充分约定。

施工过程中的审计

监控工程进度，检查是否按计划推进，是否存在延误或超期现象。

对施工质量进行审查，确保工程质量符合设计要求和国家标准。

检查项目过程中是否存在未经批准的设计变更或施工变更，是否存在不合理的索赔行为。

对施工过程中产生的费用进行审计，确保支出的合理性和合规性，避免工程款项的虚增或浪费。

验收与竣工审计

对工程竣工后的最终结算进行审计，确保结算金额的准确性与合规性，防止虚报、漏报情况。

进行质量验收与安全审计，确保工程质量和安全符合要求。

竣工财务决算审计

将造价工程师审定的单项、单位工程的总造价与未经造价工程师审核的所有支出加在一起，审查其是否有不合理支出，是否有挤占建设成本和计划外建设项目的现象。

确定一个建设项目的总的造价及工程管理过程是否合规合法。

审计方法

看图法：通过仔细查看施工图纸，核实工程量与工程价款，审定工程造价。

观察法：亲临现场，实地观察，了解建设项目的实际情况，发现疑点。

询问法：通过询问相关管理人员和当事人，证实工程量与工程价款的真实性、合理性。

调查法：深入实际进行调查研究，查证工程量与工程价款的真实性、合理性。

开挖法：对有疑点的隐蔽工程进行挖开核实。

分析法：运用系统方法，对工程项目内容进行分离和分类，综合分析，发现疑点。

测量法：实地测量工程量，计量器材物质数量，确定工程造价的真实性、合理性。

核对法：用记录或资料相互验证，复核工程量与造价的真实性、合理性。

通过这些步骤和方法，工程审计旨在确保工程项目的合法性、合规性、经济性及效益性，从而保障工程目标的顺利实现。