水利工程项目纳税主要涉及以下几个方面：
增值税
水利建设专项收入一般属于增值税免税项目，因此不需要缴纳增值税。
如果收入中包含增值税应税项目的部分，需要按照增值税规定缴纳增值税。
企业所得税
水利建设专项收入属于企业经营所得，需要缴纳企业所得税。
企业应根据水利建设专项收入的具体情况计算应纳税所得额和应纳税额，按照规定申报纳税申报表并缴纳企业所得税。
印花税
水利建设专项收入一般不需要缴纳印花税。
但如果收入中包含应纳印花税的部分，需要按照规定缴纳印花税。
水利建设基金
水利建设基金按经营收入的千分之一缴纳。
税率按照所在地分为：市区7%，县城和镇5%，乡村1%。
大中型工矿企业所在地不在城市市区、县城、建制镇的，税率为1%。
教育费附加是增值税、消费税适用税率三者之和的3%。
地方教育费附加，按实际缴纳的（增值税+消费税）的2%缴纳。
城市维护建设税和教育费附加
以营业税等流转税为依据，分别适用7%、5%、1%征城市建设维护费，依3%计征教育附加费。
房产税
对拥有房屋产权的内资单位和个人按照房产税原值或租金收入征收，税率为1.2%。
个人所得税
税率1%-2%，各地稍有差别。
建议
企业应当咨询当地税务机关或专业税务顾问，以确保准确理解和遵守相关税收政策。
税务申报时，需提供相关证明和材料，确保合规性审查通过。
关注税收优惠政策，如水利工程建设和运营的税收减免等，以降低税负。
