根据教育部公布的第四轮学科评估结果，国内软件工程专业最好的大学有以下几所：

北京航空航天大学：

被教育部评为A+，综合教学实力全国第一，尤其在嵌入式系统、航空航天软件等方面具有独特的教学经验。

浙江大学：

同样被教育部评为A+，软件工程专业实力强劲，注重培养学生的创新思维和实践能力，在人工智能、大数据处理等领域有独特的教学优势。

国防科技大学：

被教育部评为A+，作为军事院校，其软件工程专业注重培养学生的系统设计和安全防。

北京大学：

被教育部评为A，软件工程专业依托其强大的计算机科学基础，注重理论与实践相结合，培养了大量优秀的软件工程人才。

清华大学：

被教育部评为A，软件工程专业拥有雄厚的师资力量和先进的教学设施，科研成果丰硕，毕业生就业前景广阔。

南京大学：

被教育部评为A，软件工程专业注重理论与实践的结合，拥有多个国家级科研项目和实验室，为学生提供了良好的学习和科研环境。

武汉大学：

被教育部评为A，软件工程学科实力强大，综合教学实力仅次于北京航空航天大学、浙江大学和国防科技大学。

华东师范大学：

被教育部评为A，软件工程专业综合教学实力强大，办学水平较高。

上海交通大学：

被教育部评为A，软件工程专业拥有高水平的师资队伍和科研平台，注重培养学生的创新思维和工程实践能力。

哈尔滨工业大学：

被教育部评为A，软件工程专业在多个排名中位列前十名，教学质量和科研实力均较高。

建议：

如果你对航空航天软件、嵌入式系统等领域有浓厚兴趣，北京航空航天大学是一个非常好的选择。

如果你希望在人工智能、大数据处理等前沿领域发展，浙江大学是一个理想的选择。

如果你有志于从事军事软件研发，国防科技大学将是一个很好的平台。

如果你希望获得扎实的计算机科学基础和丰富的实践经验，清华大学和北京大学都是顶尖的选择。

如果你注重理论与实践的结合，南京大学和上海交通大学是不错的选择。

根据你的具体兴趣和职业规划，可以选择最适合自己的大学和专业。