农业工程师可以考取的证书主要包括以下几种：

农业工程师资格证书

这是一种专业认证，证明持证人具备处理农业工程问题的能力，包括土壤、灌溉、肥料管理、作物保护等方面的知识和实践经验。

农业顾问资格证书

该证书为农民和企业提供咨询和指导，涉及种植、养殖、市场分析等方面的知识和实践经验。

农业管理资格证书

证明持证人具备管理和组织农业相关活动的能力，包括农业生产、农产品加工、农业市场营销等方面的知识和实践经验。

农业金融资格证书

证明持证人具备处理农业金融问题的能力，包括农业贷款、保险、税收等方面的知识和实践经验。

农业技术资格证书

证明持证人具备使用现代农业技术的能力，包括农业机械、农业信息技术、农业生物技术等方面的知识和实践经验。

农业环境资格证书

证明持证人具备处理农业环境保护问题的能力，包括农业资源管理、农业生态系统保护、农业污染控制等方面的知识和实践经验。

注册安全工程师职业资格证书

该证书适用于从事安全生产管理、安全工程技术工作或提供安全生产专业服务的专业技术人员，分为初级、中级和高级三个级别。

农业推行员资格证书

这是农业推行工作的基本资历证明。

农业技术员资格证书

这是从事农业生产和农业技术工作的基本技能证明。

农业工程师资历证

这是从事农业工程技术研究和设计的职业资历证书。

农业经济师资历证

这是从事农业经济分析和预测的职业资历证书。

农作物栽培技术员证书

证明持有者具备一定的农作物栽培知识和技能，具体报考条件因地区和具体要求可能有所不同。

建议根据个人的职业发展方向和兴趣，选择合适的证书进行考取，以提升自己的专业水平和市场竞争力。