合伙做工程存在以下弊端：

利益分配问题：

由于每个人的投入、贡献和承担的风险不同，对利益的期望也会有所不同。即使在合作之前已经达成了协议，也总会有人觉得自己得到的利益不够公平，从而产生不满和矛盾。

责任与风险：

合伙人的责任比公司股东的责任大得多，合伙人之间的连带责任使合伙人需要对其合伙人的经营行为负责，更加重了合伙人的风险。

家庭因素的影响：

即使工程进展顺利，只要有一方的配偶或家人对合作不满意，合作就可能会破裂。由于家庭因素对个人决策和态度有重要影响，因此即使双方在合作初期达成了共识，但只要有一方的家人或配偶对合作提出质疑或反对，就可能会使合作难以继续。

稳定性问题：

合伙企业具有浓重的人合性，任何一个合伙人破产、死亡或退伙都有可能导致合伙企业解散，因而其存续期限不可能很长，导致管理分散，企业稳定性低。

意见分歧：

大家思想不统一，意见不一致，容易形成分歧和人际关系矛盾。在创业过程中，会遇到各种各样的问题，需要参与经营的各合伙人协商一致拿出对策方案，然而大家各有各的想法、看法、观点与意见。

责任减少与期望增加：

有了合伙人的入伙，各合伙人认为公司、组织是大家的，与自己单独创业相比较而言，责任心少了；同时也对其他合伙人在公司、组织中的努力程度、贡献程度形成了较高的期望值，但现实往往事与愿违，合伙人的表现不尽人意，时间长了各合伙人之间就会形成抱怨和憎恨，最终可能导致合伙人的退伙甚至创业失败。

个人意志不体现：

合伙创业所做的决策往往是主合伙人意志的体现，其他合伙人虽然有时不同意，但也只能附和罢了，个人意志无法得到充分体现。

资金与信用限制：

资金来源和企业信用能力有限，不能发行股票和债券，这使得合伙企业的规模不可能太大。

内部关系复杂：

内部员工关系会变得复杂，非承包员工就得给承包员工打工，关系如何处理。

贫富差距拉大：

企业内部贫富差距迅速拉大，造成企业内部的社会性问题。

道德风险：

如果某一利益主体的业务交易关系和治理交易关系有一定联动影响，则很有可能会产生道德风险，例如通过做好当期的业绩或者修饰当期财务报表，拉升短期股票等。

债务承担问题：

合伙人对债务承担无限责任，风险较大。如果一个合伙人有能力还清整个企业的债务，而其他合伙人连还清自己那份的能力都没有时，按连带责任来讲，这个有能力的合伙人应该还清企业所欠所有债务，但他如果这样做了，再去找其他合伙人要回自己垫付的债款就麻烦了。

综上所述，合伙做工程在带来资金来源广、分担工作压力等优点的同时，也存在着利益分配不均、责任重大、家庭因素影响、稳定性差、意见分歧、责任心减少、个人意志不体现、资金与信用限制、内部关系复杂、贫富差距拉大、道德风险和债务承担问题等诸多弊端。