工程亏钱的原因可以归纳为以下几点：

客观原因

中标价格过低：为了获得中标，企业可能采取低价策略，导致中标价格低于成本，从而造成亏损。

地质及气候的变化：地质变化可能导致施工时间延长，机械使用费减少，而人工费、材料费和间接费增加，影响总成本。气候变化如冬、雨季施工也会增加额外费用。

设计变更：工程的各项设计变更会导致成本变化，影响总成本。例如，发包单位增加工程数量、延长或缩短施工工期、改变施工方案等。

企业新增要求：企业有时会在施工中增加额外要求，如组织大战或达到某个质量标准，导致人员、设备投入增加和材料浪费。

施工组织设计欠合理：投标与施工现场实际差异可能导致施工组织设计存在不合理现象，如人员、材料、设备计划和安排出现误差，影响成本费用。

息工：工程任务衔接不上或其他原因导致息工，若息工时间较长，费用数额较大且企业不予核销，也会形成亏损。

主观原因

严重的质量问题：亏损严重的项目部通常存在严重的质量问题，导致返工、修复、推倒重来等重复施工，增加成本。

施工安排不合理：不能合理配置人力、材料、设备等资源，导致窝工浪费。

预算偏差：预算不准或存在疏漏，导致实际成本超出预算。

关系处理不当：不会处理与业主、监理、总包等各方的关系，可能因小失大。

隐形成本过多：图纸现场看了初步一算等于将近20%的利润，但实际中区间费、代班工资等隐形成本导致利润减少。

资源配置不合理和管理混乱：资源配置不合理和管理混乱会导致项目进度延误、成本增加。

内部矛盾：合伙人之间的内部矛盾会导致精力内耗，不再专注于项目推进。

政策变动和总包方问题：政府政策调整或总包方决策失误可能导致工期延长或成本增加。

安全事故：安全事故会导致额外支出，影响项目利润。

其他原因

垫资实力不行或不匹配：垫资到一定程度可能无法继续，导致违约和罚款。

忽略隐形成本：如居间费、窝工、停工、返工、二次搬运费等未考虑在内。

关系不到位：未能有效处理与各方的关系，导致进度不顺畅，收不到款项。

综上所述，工程亏钱的原因多种多样，既包括客观环境的影响，也包括管理层自身的主观因素。为了避免亏损，企业应从多方面入手，包括合理制定预算、加强成本控制、优化施工组织设计、处理好各方关系、关注政策动态等。