工程渠道存在的问题主要包括以下几个方面：

原材料问题

原材料质量参差不齐，如砂、碎石等级配不均匀，水胶比和砂率选择不符合招标文件要求，导致工程早期出现裂缝。

施工过程中的问题

垫层厚度不足，混凝土板砌筑不平整，勾缝不实等施工质量问题。

施工期间管理不善，如混凝土板不能始终保持在湿润环境中，导致干缩裂缝和砂浆脱落。

设计问题

设计阶段未充分考虑实际施工条件和环境，导致设计与实际施工不符，影响施工质量和进度。

设计人员缺乏成本意识，设计方案过于简单，未充分考虑施工成本预算。

施工困难

渠道沿线存在大量生活建筑设施、垃圾和杂物，导致水流阻力增大，抗沙能力降低，造成淤积。

施工车辆无法通行，混凝土运输困难。

安全隐患

农田水利工程渠道施工中存在安全隐患，如渗漏严重，渠系水利用系数低，影响农业生产。

施工人员文化程度低，应变能力差，工程质量难以保障。

配套设施缺乏

农田水利工程严重老化，配套设施缺乏，维护保养不到位，导致渠道功能失效。

配套设施多为临时性工程，工程质量难以保障。

技术落后

农田水利渠道建设技术应用不当，设计粗糙，建设标准低，导致工程运行困难，维护维修困难。

渠道边坡垮塌、渗漏等安全问题频发，影响灌区安全。

后期管理问题

渠道工程后期管理不善，疏于维护保养，导致渠道功能逐渐丧失。

综上所述，工程渠道存在的问题涉及原材料、施工过程、设计、施工困难、安全隐患、配套设施、技术和管理等多个方面。解决这些问题需要从多个角度出发，加强原材料质量控制，严格施工过程管理，提高设计质量，改善施工条件，增强安全意识，完善配套设施，提升技术水平，并加强后期管理维护。