工程审计主要审查以下内容：

中标通知书：

审计中标通知书的简单明了性，确认是否中标，合同签订时间和地址的确定情况。

招标文件（工程量清单）：

确认工程量清单中是否存在问题，审计工程清算计价方式，报价与技术标之间的关系。

图纸会审记录：

审查图纸会审的相关记录。

监理工程师的通知或业主的施工指令：

审计这些文件的内容和执行情况。

施工合同审计：

审查合同内容，确保双方权利和义务符合法律条款。

设计变更审计：

审计设计变更的内容和过程，确保变更合理合规。

工程结算审计：

审计工程结算款，确保结算金额准确无误。

建设准备情况审计：

审计建设项目的审批文件，招标投标过程，以及项目法人的质量控制、监理工作和施工单位选择。

投资决策审计：

审计建设项目的资金来源是否落实到位、合理及专户存储。

经济合同审计：

审计经济合同的合法性和执行情况。

勘察设计审计：

审计勘察设计的质量和合规性。

投资完成审计：

审计投资项目是否按计划完成。

投资项目竣工决算审计：

审计竣工决算的完整性和真实性。

投资效益审计：

审计投资项目的社会效益和经济效益。

竣工财务决算报表和说明书审计：

审计报表和说明书的完整性、真实性。

建设投资支出的真实性、合规性审计：

审计各项建设投资支出是否符合规定。

建设工程竣工结算的真实性、合规性审计：

审计竣工结算是否符合相关规定。

概算执行情况审计：

审计项目概算的执行情况。

交付使用资产真实性、完整性审计：

审计交付使用资产的真实性和完整性。

结余资金及基建收入审计：

审计结余资金和基建收入的情况。

尾工工程审计：

审计尾工工程的情况和处理。

工程造价审计：

对单项、单位工程的造价进行审核，按照工程量套定额。

竣工财务决算审计：

将造价工程师审定的造价和未经造价工程师审核的所有支出加在一起，审查其合理性和合规性。

这些审计内容旨在确保工程项目的合规性、真实性和效益性，保障建设项目的顺利进行和资金的有效使用。