制药工程专业的女生在考研时，可以考虑以下专业：

药学：

药学是研究药物的科学，包括药物的发现、开发、制剂、质量控制、作用机制、代谢、药效学、药物经济学以及药物对个体和社会的影响等多个方面。药学专业的研究生课程可以为制药工程背景的女生提供深入的理论知识和实践技能。

药物分析：

药物分析是研究药物及其制剂的质量控制方法的科学，包括药物的定性分析、定量分析、仪器分析等。这一专业可以帮助女生掌握药物的质量控制技术，确保药物的安全性和有效性。

天然药物化学：

天然药物化学是研究天然来源的药物成分的化学结构、生物活性和药理作用的科学。这一专业适合对天然药物感兴趣的女生，可以从事药物的研发和开发工作。

药物制剂：

药物制剂是研究药物制剂的设计、制备、质量控制和应用的科学。这一专业可以帮助女生了解药物制剂的生产工艺和制剂技术，为药物的研发和生产提供技术支持。

药事管理：

药事管理是研究药品在研发、生产、流通、使用等过程中的管理科学的学科。这一专业适合希望从事药物管理和政策制定的女生。

生物化工：

生物化工是研究生物体内化学过程及其在工业上应用的科学。这一专业可以帮助女生将生物技术与制药工程相结合，从事生物药物的研发和生产。

化学工程与技术：

化学工程与技术是研究化学工业过程及其设备的技术科学。这一专业可以帮助女生掌握化工过程的基本原理和操作技能，为制药工程提供技术支持。

中药学：

中药学是研究中药的理论、应用、开发等方面的科学。这一专业适合对中药感兴趣的女生，可以从事中药的鉴定、研究、制剂和临床应用等工作。

选择考研专业时，建议女生结合自己的兴趣和职业规划，综合考虑各个专业的课程设置、研究方向和就业前景。同时，也可以咨询导师或学长学姐，获取更多的建议和信息。