工程清标的过程主要包括以下几个步骤：

收集投标文件

由招标人或招标代理机构负责收集所有投标人提交的投标文件。

投标文件编目

将收集到的投标文件进行编目整理，确保文件的完整性和一致性。

文件资格审查

对合格投标人的资格进行初步审查，排除不符合资格要求的投标人。

对合格投标人的投标文件进行资料齐备性审查，确认其提供的文件资料是否完整齐备。

偏差性审查

对比招标文件，判断投标人的投标文件是否完全响应招标文件的要求。

符合性审查

分析投标文件，判断是否有更改招标文件中的工程量清单内容、漏项、多项等问题。

算术性错误检查

检查投标文件中的工程量计算和报价是否有计算错误。

合理性分析

重点审查工程量大的单价和单价过高或过低的项目，以及是否有串标围标的行为。

其他检查

要求投标单位按照原有的模式报价的情况，可以通过清标软件检查出来，例如筑龙清标卫士等，不需人工操作。

不平衡报价检查

评审基准价的确定，通常参考招标文件中约定的评标办法（如合理低价法、次低价法、综合评分法等）确定基准价。

完成基准价的确定后，对比分部分项的清单综合单价，并进行分布分析清单分析。

形成清标报告

通过比对分析后，最终形成一份清标报告，供评标委员会参考。

清标是工程招投标过程中的重要环节，其目的在于找出投标文件中存在的各类问题、偏差以及不符合招标文件要求的地方，为后续评标专家能更高效、准确地进行评标工作提供清晰、有条理的依据。清标报告是评标委员会进行评审的主要依据，其准确与否将可能直接影响评标委员会的评审结果和最终的中标结果。