做工程赔钱的原因有很多，以下是一些常见的原因：

垫资能力不行或不匹配

垫资到一定程度可能就垫不动了，导致违约和罚款。

盲目相信别人所说的哪个行业挣钱，而应根据自身资金实力选择项目。

预算不准或商务能力差

预算做的不准，导致项目中途资金不足或资金浪费。

不会处理关系，因小失大，例如监理、总包、项目经理等关系处理不当。

隐形成本太高

图纸现场看了，初步一算等于将近20%的利润，但实际隐形成本很高，如工期拖延、人情世故等。

忽略了很多隐形成本，比如居间费、窝工、停工、质量返工、二次搬运费等。

管理不善

项目管理不当，导致成本控制不住、进度延误、质量不合格等问题。

资源配置不合理，管理混乱，导致内耗严重。

安全事故

工地安全事故赔偿标准很高，有时候利润还不够赔。

政策和总包甲方原因

由于政策和总包甲方的原因，导致工期拖延太长，费用大幅增加。

市场环境变化

市场竞争激烈，导致建筑业经济效益普遍低下，企业采取低价中标策略，盈利靠索赔。

材料和劳动力成本增加

在工程项目进行过程中，材料和劳动力成本难以控制，如果成本增加超出预期，就会导致亏损。

合同问题

合同不够严密，文件之间互相矛盾，导致索赔。

价格变动、工程设计变更、业主方履约不及时等合同因素也会导致亏损。

内部管理和人际关系问题

公司内部看不见的大大小小的手太多，管理机制跟不上，导致资金流失。

合伙人之间内部瓦解，相互猜忌，精力都放在内耗上了。

综上所述，做工程赔钱的原因多种多样，从垫资能力、预算准确性、隐形成本、管理不善、安全事故、市场环境、合同问题到内部管理和人际关系等各个方面都可能出现问题。因此，要避免亏损，需要在这些方面做好充分的准备和管理。