工程审计决算的进行过程包括以下几个步骤：
现场检查和记录
对施工现场进行实地检查，核实工程进展、质量、安全等情况。
对发现的问题和疑点进行详细记录，并收集相关证据。
审计结果汇总与报告编制
汇总审计结果，编写审计报告初稿。
将审计报告初稿送达被审计单位征求意见，根据反馈意见进行修改完善。
经审核无误后，正式提交审计报告给相关领导和部门。
竣工财务决算审计流程
资料收集与审前调查：接收并登记被审计单位送达的竣工财务决算资料，如财务报表、账簿、凭证、合同文件等，了解项目概况、资金来源、使用及结余情况，初步评估审计风险。
审计报告编制与提交：汇总审计结果，编写审计报告初稿，征求意见与修改，提交审计报告。
审计回访与跟踪
在项目竣工一段时间后，进行审计回访，检查审计建议的落实情况。
对审计结果进行跟踪监督，确保问题得到有效整改。
对工程决算报告内容的审查
审查项目竣工决算报告的编制情况，包括编制依据、资料齐全性、手续合规性、项目遗留问题处理合规性等。
审查项目建设和概算实施情况，重点关注项目建设是否按照批准的初步设计概算进行，分析超概算或节约的具体内容和原因。
审核建设项目资金来源，审核建设资金来源是否与设计概算内容一致，工程建设过程中建设资金到位情况。
通过以上步骤，审计机关能够对工程项目的财务状况、管理情况、合规性进行全面审查，确保工程项目的真实性和合法性，并提出相应的审计意见和建议。
