制药工程辅修的专业选择主要取决于个人的兴趣和职业规划。以下是一些建议：

药理学和药学基础

药学专业的学生需要学习并掌握药学各分支学科的基本理论和基本知识，通过药学实验方法和技能的实践训练，能够具有药物制备、质量控制及合理指导用药的基本能力。药学是一门理论方面比较强，实践方面也比较强的专业，适合对药物研发、药物管理和药物使用感兴趣的学生。

药物化学

药物化学专业主要学习药物合成、药物设计等方面的理论知识与专业技能。该专业的毕业生在就业时大多选择医药生产企业和药政机构等单位，也可以留任高校从事教育工作。

化学工程与技术

化学工程与技术简称化工，是研究以化学工业为代表的，以及其他工业生产过程中的一般原理和规律，并能够根据所掌握的基本理论解决化学工程中遇到的一些难题。本专业学生毕业后主要从事冶金、能源等方面的科研工作。

中药学

中药学专业的学生需要学习中药学基础理论和基本知识，掌握中药学的基本技能，能在中药生产、检验、流通等各个方面工作的高级科学技术人才。该专业的学生毕业后大多从事中药检验及中药的科研工作。

其他相关专业

除了上述专业，还可以考虑辅修英语、日语、德语等语言类专业，或者会计、法律、工商管理、国贸、金融等管理类专业，这些专业在制药工程领域中也会有一定的帮助。

建议：

如果你对药物研发和药物管理感兴趣，建议选择药学或药理学专业。

如果你对化学和化工有浓厚的兴趣，化学工程与技术是一个不错的选择。

如果你对中医药感兴趣，中药学是一个值得考虑的方向。

如果你希望拓宽就业领域或增强个人竞争力，可以考虑辅修英语、日语等语言类专业或管理类专业。

最终的选择应结合你的兴趣和职业规划，选择最适合自己的发展方向。