制药工程专业的课程主要分为基础科学课程、制药工程基础课程、制剂学、药物化学、生物制药、药物动力学、药物管理与质量控制、实验室技术与实践等几个主要部分。具体课程包括：
基础科学课程：
如高等数学、大学物理、有机化学、无机化学、分析化学等。
制药工程基础课程：
包括制药工程原理、制药工艺学、制药设备与工艺、制药工程自动化等。
制剂学：
包括药物制剂学、药物包装与储存、药物分析等。
药物化学：
包括药物合成、药物分析、药物代谢等。
生物制药：
包括生物工程原理、发酵工程、生物制药工艺等。
药物动力学：
研究药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄等过程，以及药物的药效学和毒理学。
药物管理与质量控制：
包括药物管理法规、药品注册与审批、药品质量控制等。
实验室技术与实践：
包括制药实验技术、药物分析实验等，培养实验操作技能和数据分析能力。
此外，根据不同的专业方向，如中药制药，还需要学习中药学、中药化学、中药制剂分析、中药药剂学、方剂学等课程。部分农药制药工程学科还需要学习植物学、农药学等课程。
总体来看，制药工程专业的课程设置注重理论与实践相结合，旨在培养具备制药工程领域高级人才所需的基本理论和技能。
