生物工程专业的毕业生有多种职业选择，主要包括以下几个方面：

生物医药行业

制药公司：从事药物研发、生产、质量控制、销售等工作。例如，进入连云港的制药公司如瀚森药业、恒瑞制药、中国生物制药等。

生物科技公司：从事生物制品、生物技术的研发工作，如基因检测、干细胞技术等。

生物化工行业

生物制品生产：利用微生物发酵技术生产药品、生物燃料等。

化工企业：从事生物工程相关的产品开发、生产、管理等工作。

科研与教学

高校和科研机构：从事生物工程相关的教学和研究工作。

医疗器械与环保行业

医疗器械设计与制造：从事医疗器械的设计、制造、应用、维修等工作。

环保部门：从事环保治理、检测等工作。

其他相关领域

食品行业：从事食品生物技术方面的应用研究、工程设计、产品开发、生产、管理等工作。

能源行业：从事生物能源的开发、生产等工作。

商检与质检：从事生物产品的技术开发、工程设计、生产管理及产品性能检测分析等工作。

建议

选择专业分支：根据个人兴趣和职业规划，选择适合自己的专业分支，如制药、生物化工、食品等。

继续深造：生物工程专业科技含量较高，进一步深造（如硕士、博士）有助于提高就业竞争力和专业水平。

实践经验：在校期间，尽量多参与实习和实践活动，积累实际工作经验，这对就业非常有帮助。

网络与关系：建立良好的人际关系网络，了解行业动态，获取更多的就业机会。

通过以上分析，生物工程专业的毕业生可以根据自身情况选择合适的职业发展方向，并在实践中不断提升自己的专业技能和竞争力。