工程企业需要缴纳的税种主要包括以下几种：
增值税
一般纳税人增值税征收率为3%，即销项税额减去进项税额的差额，一般情况按月度申报。
小规模纳税人增值税征收率为3%。
企业所得税
一般企业所得税税率为25%。
小微企业年应纳税所得额不超过100万元的部分，减按25%计入应纳税所得额，并按20%的税率缴纳企业所得税；年应纳税所得额超过100万元的部分正常缴纳企业所得税。
个人所得税
主要针对企业员工工资薪金，按工资的多少，根据九级累进税率计算交纳，由企业代扣代缴。
印花税
涉及企业的营业账簿，每本五元，资金账簿按记载注册资本与资本公积合计的万分之五交纳。
建筑合同按合同金额的万之分三交纳。
城市维护建设税
根据缴纳的增值税额来计算，税率按照工程所在地的城乡类型不同分别确定，市区为增值税额的7%，乡镇为增值税额的5%，其他为增值税额的1%。
教育附加税和地方教育附加税
教育费附加按实际缴纳的营业税税额计算缴纳，税率为3%。
地方教育费附加按实际缴纳的营业税税额计算缴纳，税率为2%。
其他费用
包括工会经费、残疾人保障基金等由税务机关代收的费用。
综上所述，工程企业需要缴纳的税种和费用较多，涉及多个不同的税率和计算方法。企业应仔细了解相关税收法规，合理规划税务事宜，以降低税务成本并确保合规经营。
