工程公司交纳的税种主要包括以下几种：
增值税：
一般纳税人企业的增值税征收率为3%，即销项税额减去进项税额的差额。目前没有增值税税收优惠政策。
城市维护建设税：
根据缴纳的增值税额来计算，税率按照工程所在地的城乡类型不同分别确定，市区为增值税额的7%，乡镇为增值税额的5%，其他为增值税额的1%。
教育费附加和地方教育费附加：
根据缴纳的增值税额来计算，教育费附加的税率为增值税额的3%，地方教育费附加的税率为增值税额的2%。
企业所得税：
按季度预交申报，年底汇算清缴。如果该一般纳税人工程企业属于小微企业的，目前国家给与小微企业企业所得税税收优惠。小微企业年应纳税所得额不超过100万元的部分，减按25%计入应纳税所得额，并按20%的税率缴纳企业所得税。
印花税：
根据经济活动和经济交往中订立、领受具有法律效力的凭证的行为所征收，不同合同类型适用不同的税率，例如加工承揽合同、建设工程勘察设计合同、货运运输合同、产权转移书据的税率为万分之五，建筑安装工程承包合同的税率为万分之三。
个人所得税：
个人承包工程的需要交个人所得税，如果是企业承包的需要交企业所得税。
房产税：
出租房屋的，按租金收入的12%，自用的按房屋原值扣除一定比例后按1.2%。
土地使用税：
按占用土地的面积计算，各地的税率也不一样。
建议工程公司在日常经营中要关注税收政策的变化，合理规划税务事宜，以降低税负并确保合规经营。
