制药工程专业可以考取的证书包括：

医师资格证：

适用于医学专业本科以上学历，在医疗、预防、保健机构中试用期满一年的药学技术人员。

药剂师证：

负责提供药物知识及药事服务的专业人员，通常在医院、药店等医疗机构工作。

执业药师证：

经全国统一考试合格，取得《中华人民共和国执业药师职业资格证书》并经注册，在药品生产、经营、使用和其他需要提供药学服务的单位中执业的药学技术人员。

安全工程师证：

适用于从事安全生产管理工作的专业技术人员。

注册化工工程师证：

由权威认证的行业组织颁发，涵盖化工工程领域的专业知识。

环评工程师证：

适用于从事环境影响评价工作的专业技术人员。

环保工程师证：

适用于从事环境保护工作的专业技术人员。

注册建造师一级、二级证：

适用于从事建设工程管理工作的专业技术人员。

药品生产许可证：

证明企业具备药品生产资质。

GMP认证证书：

药品生产质量管理的基本要求，涉及药品生产、质量控制、设备管理等方面的知识。

GSP认证证书：

药品经营质量管理的基本要求，涉及药品采购、储存、销售、售后服务等方面的知识。

医药代表资格证：

具备专业的医药知识和沟通能力，适用于药品销售岗位。

药品注册与审批证书：

掌握药品注册与审批的流程和要求，适用于药品研发、注册等工作的专业人员。

药品生产管理证书：

涵盖制药工程中的生产规程、质量管理、设备管理、环境管理等方面的知识。

建议根据个人职业发展方向和兴趣，选择合适的证书进行考取，以提升在制药工程领域的专业竞争力。