工程停工索赔的费用主要包括以下几个方面：

人工费

停工待命人工费：因停工原因消除后工程还需继续进行，导致工人不能离开现场，从而产生的人员窝工费用。计算方法为：离工期间工人工资数额 × 窝工人数 × 窝工工日。

增加工作内容的人工费：因停工导致需要额外增加的工作内容所产生的人工费用。

机械设备费

施工机械停滞补偿费：仅限于停工前后施工所需的不能移动的尚未拆除的机械。计算公式为：某种机械在停工期间的损失费 = [（此机械购进原值 - 此机械报废后残值） / 正常情况下此机械预期使用时间 × 停工时间]。

机械台班费、机械折旧费、设备租赁费等：根据机械的不同形式和费用计算方式。

材料费

周转材料停止补偿费：包括停工期间已支设的未浇混凝土和未拆除的脚手架等。

已进场原材料、加工好半成品的报关费、已完工程成品保护费等：因停工导致材料无法使用而产生的费用。

管理费

现场管理人员工资和公司管理费：因停工期间仍需支付的管理费用。

规费和税金

规费：一般要计取，但停工索赔费用不计取利润。

税金：一般要计取。

返工费用

非承包人原因引起的停工，复工前一般都要整改，产生额外的返工费用。

行政处罚类费用

非承包人原因引起的停工，可能会产生政府主管部门的行政处罚，若由施工方代缴，则该费用也应计入停工索赔费用。

其他直接费用

现场排污费、冬雨季防护费等：因停工期间仍需支付的其他直接费用。

预期利润

因工程停工撤场，施工单位在本工程将无法实现预期利润，可以向业主索赔预期利润。

延迟付款利息

若因停工导致工程延期，可能会产生延迟付款利息。

在实际操作中，停工索赔费用的计算应依据合同约定、双方协商以及相关法律法规进行。建议承包人在进行停工索赔时，详细列出各项费用，并提供充分的证据支持，以确保索赔的合理性和有效性。