工程咨询行业存在以下缺点：

综合水平较低，缺乏社会信誉

咨询行业服务范围有限，多数企业仅提供阶段性咨询服务，工作效果不尽如人意。

监理咨询多处于以施工阶段质量控制为中心的低水平阶段。

咨询公司可能为完成程序而放弃职业道德，提供不严谨的咨询服务。

设计人员可能因赶业务而牺牲设计质量。

风险性分析不到位

咨询人员缺乏实践经验，对资源风险、汇率利率变动等认识不足，无法提出有效的防范措施。

以设计、研究为主体的企业定位不合理

这些企业向工程总承包方向发展可能不适宜。

竞争激烈

咨询工程师行业门槛较低，市场竞争激烈，需要强大的专业技能才能脱颖而出。

工作周期长

咨询工程师需对企业进行全面检查和分析，提出完善方案，周期较长，需要耐心和细心。

工作强度大

咨询项目过程中存在许多不确定因素，咨询工程师需付出更多努力，具备良好的心理承受能力。

行业发展不平衡

各地全过程工程咨询服务供给不均衡，一些地区缺乏高素质人才和专业机构。

行业标准化程度不高

全过程工程咨询领域需要提高标准化程序和要点，以保证建设项目顺利推进。

价格竞争激烈

由于市场上有大量的咨询机构、专家和团队，价格竞争日益加大。

专业性较弱

一些企业咨询范畴不够精细，导致咨询过程中帮助低，意见单一。

责任不清

EPC公司承担整个工程责任，在发生工程纠纷时，责任界定困难。

市场环境劣势

公平竞争机制尚未形成，行业受部门、地域影响较大，导致咨询任务分配不合理。

人力资源劣势

具备全面业务知识和能力的咨询人员较少，执业人员素质偏低。

机制劣势

咨询企业往往隶属于政府部门或事业单位，服务的客观性和公正性受质疑。

咨询服务范围劣势

国内咨询企业服务范围相对较小，难以承揽国内外各类工程。

业务单一，市场空间狭小

咨询业务单一，市场空间有限，公平有序的市场机制亟待完善。

从业人员技术和素质待提高

建设工程咨询从业人员技术和素质尚待提高，业务过于单一，发展规模小。

市场竞争无序

行业内竞争激烈，市场竞争无序，引导错位，阻碍了行业的发展。

系统问题约束

工程咨询业由多个部门主管，缺乏统一的法律制度和工业政策，难以形成规范有序的市场系统。

业务范围不全面

工程咨询单位业务范围不全面，服务过程分阶段分部门，影响咨询服务的连贯性和有效性。

综上所述，工程咨询行业在多个方面存在不足，需要从提高人员素质、加强行业标准化、完善市场机制等方面进行改进和提升。