发酵工程的原料类型主要包括以下几种：
淀粉质原料
主要包括粮食原料如玉米、小麦、大米等。这些原料通过预处理（如除杂、粉碎）和淀粉糊化（如水热处理）后，可供微生物发酵使用。
糖质原料
包括糖蜜、蔗糖、甜菜糖等。这些原料可以直接用于发酵过程，提供微生物所需的碳源。
纤维质原料
如木质纤维素、农作物秸秆等。这些原料可以通过适当的处理转化为可发酵的糖类物质，用于微生物发酵。
石油化工产品
某些石油化工产品如某些有机酸、氨基酸等可以作为发酵原料。
其他原料
包括野生植物类等，这些原料含有多种营养成分，可用于特定类型的发酵过程。
有机氮源和无机氮源
微生物发酵过程中需要氮源，通常加入少量的有机氮源（如蛋白胨、酵母粉）和无机氮源（如硫酸铵、硝酸铵）以提供氮元素。
废水和废物
利用废水和废物作为发酵原料，进行生物资源的改造和再利用，既减少环境污染，又节约资源。
这些原料通过不同的发酵工艺，可以生产出各种有用的产品，如氨基酸、有机酸、抗生素、酒精、维生素等。根据发酵的特点和微生物对氧的需求不同，发酵工程可以分为糖类物质发酵、石油发酵、废水发酵等类型，并且还可以进一步细分为固体发酵、液体发酵、分批发酵、连续发酵、流加发酵等。
