基因工程可能带来的一些负面效应包括：

生态环境安全性问题

食物链破坏：转基因农作物可能改变食物链，导致生态平衡受损。

基因污染：外源基因可能通过基因漂流进入其他有机体，造成自然界基因库的混杂或污染。

新型病毒出现：制造带有抗生素抗性基因或产生病毒能力的基因的新型微生物可能在人类或其他生物体内传播。

癌症扩散：将肿瘤病毒或其他动物病毒的DNA引入细菌可能扩大癌症的发生范围。

人造生物扩散：重组DNA生物体可能意外扩散，造成不同程度的潜在危险。

人体健康威胁

免疫力问题：转基因生物及其产品可能降低动物乃至人类的免疫能力。

抗药性问题：转基因过程中使用的抗生素抗性基因可能转移到细菌中，使细菌产生抗药性。

过敏原问题：某些转基因食品可能导致特定蛋白质的过敏反应。

伦理道德问题

任意修改基因组：基因编辑技术可能导致人类对基因组的任意修改，引发道德和伦理方面的担忧。

设计婴儿：基因工程可能用于设计婴儿，引发对未来社会公平性和人类尊严的疑虑。

社会和经济问题

公众担忧：基因工程的安全性和伦理问题引发公众的广泛担忧。

监管挑战：基因工程技术的监管存在挑战，需制定严格的安全准则和控制措施。

技术难度和成本

技术要求高：基因工程技术难度大，需要高度专业的设备和技术人员。

经济成本：基因工程的研究和应用需要巨大的经济投入。

综上所述，基因工程虽然具有巨大的潜在益处，但其负面效应也不容忽视。在推进基因工程技术时，必须充分考虑其安全性、伦理道德和社会经济影响，并采取相应的控制措施和监管政策。