隧道工程的缺点主要包括以下几个方面：
造价高：
隧道建设需要大量的资金投入，包括材料、设备、人工等方面的费用，因此造价较高。
期限长：
由于隧道工程涉及复杂的施工过程和地质条件，施工周期通常较长。
施工作业环境及条件差：
隧道内部空间有限，作业环境相对恶劣，通风、照明、除尘和空调等辅助设施必须齐全，且职业健康威胁较大。
地质问题：
隧道施工过程中常会遇到各种地质问题，如大断层、流沙、膨胀地层、溶洞和大量涌水等，这些问题需要采取相应的措施来解决。
工序多，有干扰：
隧道施工涉及多个工序，不同工序之间存在干扰，需要精心组织和协调。
用人多：
由于隧道施工的复杂性和环境条件，需要投入较多的人力进行操作和维护。
施工设备配套通用性差：
由于隧道断面形式多样，围岩性质各异，导致施工设备的配套和通用性较差，机械化推进缓慢。
地下水影响大：
隧道位于地下，施工安全与工程质量与水息息相关，地下水的影响需要特别关注。
环境污染与生态破坏：
隧道施工会对周边环境和生态系统造成一定的影响，如噪音、振动、土地占用等，需要采取相应的环保措施。
安全隐患：
隧道施工过程中存在一定的安全隐患，如崩塌、坍塌、瓦斯爆炸等，需要采取严格的安全措施。
综上所述，隧道工程虽然具有缩短线路长度、节约地皮等优点，但其缺点也不容忽视，需要在设计和施工过程中充分考虑并采取措施进行应对。
