工程跟踪审计的主要内容包括以下几个方面：

全过程跟踪审计定位与目的

根据委托审计的方式不同，定位可以是内部审计或第三方审计。

对于国家重点建设过程，会直接安排国家审计。

全过程跟踪审计的工作内容

对投资项目基本建设程序进行审核并出具审核审计意见。

对投资项目招投标进行审核并出具审核审计意见。

对投资项目合同进行审核并出具审核审计意见。

对投资项目工程管理进行审核并出具审核审计意见。

对投资项目建设资金进行审核并出具审核审计意见。

对投资项目变更、洽商、索赔进行审核并出具审核审计意见。

对工程结算、竣工决算进行审核，出具项目工程结算审计报告或竣工决算。

对业主、施工单位、监理单位的内控制度提出合理化建议和意见

完善建设项目现场管理制度，如工程签证管理、材料设备采购、价格控制、验收、领用、清点，设计变更管理制度等。

检查项目相关单位和部门的合同履行情况

检查有无违法转包、分包现象。

重点检查工程进度、合同实质条款内容发生变更时有无及时签订补充合同。

检查施工单位是否与合同单位一致。

检查项目概算执行情况

确保项目按照批准的投资概算进行实施。

控制、优化工程变更

根据工程用途及市场行情，提出建设性的优化方案。

经常深入施工现场，掌握工程进展及变更的落实情况，为准确计量掌握真实资料。

隐蔽工程的查看和验收

涉及造价增减的，要做到图片、文字资料齐全，及时办理确认手续并存档。

特殊材料、设备的定价工作

参与特殊材料、设备的定价工作，并提出合理化建议。

审核施工单位上报的已完成工作量月报

提供当月付款建议书，严格控制管理工程进度款支付审核，防止工程款超付现象。

索赔项目的审核

按照合同约定，对索赔项目进行审核，合理合法的确认工程投资，防止索赔事件的发生。

审前准备工作

收集工程相关的文件资料，如施工合同、招投标文件、编制标底等。

熟悉竣工图纸，核对所有图纸，清点无误后依次识读。

了解决算包括的范围，例如配套设施、室外管线、道路以及会审图纸后的设计变更等。

弄清所采用的单位估价表，收集熟悉相应的单价、定额资料。

建设项目跟踪审计程序及相关要求

在建设项目正式立项时，即将其纳入审计视野，关注其各项前期准备工作。

审计组应在项目现场设立办公场所，与被审计单位建立定期例会制度，参加被审计单位的重要例会，及时了解、掌握项目有关情况，提出审计意见，并且作好会议记录。

对中标合同价进行控制，不允许施工现场随意变更设计、增项、减项、扩大工程造价。

对工程用料，隐蔽工程进行质量和数量监控，防止施工单位偷工减料或以次充好。所有隐蔽工程除应有甲方施工现场管理人员、监理人员签字外，还必须有跟踪审计人员签字。

审计组成员应经常深入施工现场，掌握工程进展、变更等真实情况，了解工程建设中涉及的有关技术问题，熟悉工程计量规则及有关费用的测算办法，并且作好相关记录。

通过以上内容，工程跟踪审计能够确保工程项目的合规性、透明性和经济性，为项目的顺利实施和完成提供有力的保障。